RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	SEMA7A	O75326	666 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS4B	O75351	444 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CLDN11	O75508	207 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PAEP	P09466	180 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GLB1	P16278	677 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	COL8A1	P27658	744 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ABL2	P42684	1182 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ADAM9	Q13443	819 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HID1	Q8IV36	788 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.45	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DUX1	O43812	170 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CNTN5	O94779	1100 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CALCA	P01258	141 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RHOC	P08134	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC2A3	P11169	496 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PNLIP	P16233	465 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	NR1D1	P20393	614 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CCR1	P32246	355 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GGCX	P38435	758 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CDH4	P55283	916 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.44	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A0D9SEW6	157 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TOR1B	O14657	336 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	STX10	O60499	249 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RASGRP1	O95267	797 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	PRKCG	P05129	697 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DCT	P40126	519 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DNA2	P51530	1060 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CDC20	Q12834	499 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	LRMP	Q12912	555 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	STIL	Q15468	1287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.43	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276		K7EM74	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD1	O60671	282 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	GPD2	P43304	727 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ACADSB	P45954	432 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	SEPT6	Q14141	434 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	C5orf22	Q49AR2	442 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	ALF	Q53S48	1182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
FAM53C-208	ENST00000511276	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms