RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 AKT2P31751 481 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GRM5P41594 1212 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CENPAP49450 140 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 OVGP1Q12889 678 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC14A1Q13336 389 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf91Q3C1V1 193 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CNSTQ6PJW8 725 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TRABD2AQ86V40 505 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TMPRSS6Q8IU80 811 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PPM1NQ8N819 430 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KCTD6Q8NC69 237 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CPA5Q8WXQ8 436 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ING5Q8WYH8 240 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC5A5Q92911 643 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NACC2Q96BF6 587 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CRELD1Q96HD1 420 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CIPCQ9C0C6 399 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 USP29Q9HBJ7 922 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM165Q9HC07 324 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CHST7Q9NS84 486 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 INSL5Q9Y5Q6 135 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH1P12882 1939 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MYH4Q9Y623 1939 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 LCHNA4D1U4 455 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CYB561D2O14569 222 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TGFB1I1O43294 461 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RECQL4O94761 1208 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DCNP07585 359 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CTSEP14091 401 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HADHAP40939 763 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TUBA1BP68363 451 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM189BP81408 668 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SPRED3Q2MJR0 410 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ANO7Q6IWH7 933 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TTC27Q6P3X3 843 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 IZUMO2Q6UXV1 221 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 RFX8Q6ZV50 586 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TUBA1AQ71U36 451 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 LILRB2Q8N423 598 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 ASAP3Q8TDY4 903 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HMGB4Q8WW32 186 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FGF13Q92913 245 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NAT6Q93015 286 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAF2Q96CS3 445 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SERINC2Q96SA4 455 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PAFAH2Q99487 392 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 IL12RB2Q99665 862 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 VPS11Q9H270 941 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 LHX5Q9H2C1 402 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SIX2Q9NPC8 291 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 SCUBE2Q9NQ36 999 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 GKN1Q9NS71 199 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 HPF1Q9NWY4 346 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 DPPA5A6NC42 116 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 LRCH4O75427 683 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-213ENST00000498524 KLHL2O95198 593 aa3.98□□□□□ -1.77
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