RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PREB	Q9HCU5	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NPHS2	Q9NP85	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD3	Q9NPG1	666 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DYRK4	Q9NR20	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MYLK	Q15746	1914 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO21	O94952	628 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH8	O95206	1070 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TACR2	P21452	398 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	OXCT1	P55809	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NFIL3	Q16649	462 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN3	Q16667	212 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	AGBL4	Q5VU57	503 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ST7	Q9NRC1	585 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf142	B7Z368	130 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		K7ESM1	405 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SCAMP1	O15126	338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CETN3	O15182	167 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NEBL	O76041	1014 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL1	P05976	194 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN2	P57739	230 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM270	Q6UE05	265 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC3	Q96B67	414 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	USP25	Q9UHP3	1055 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NNZ2	444 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX15B	O15296	676 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DYRK3	O43781	588 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ALX3	O95076	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF15	O95150	251 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GJB6	O95452	261 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PAEP	P09466	180 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GLB1	P16278	677 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM2	P21980	687 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	STIL	Q15468	1287 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	DLG2	Q15700	870 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZSR6	202 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	USP53	Q70EK8	1073 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TAC4	Q86UU9	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	FRS2	Q8WU20	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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