RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496124.1

PRDM15-216, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-216ENST00000496124 RHOBTB1O94844 696 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 JCHAINP01591 159 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ITPKAP23677 461 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 CXCR5P32302 372 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ATP5OP48047 213 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ADPRHP54922 357 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 DSC2Q02487 901 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 RAD51Q06609 339 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 AGBL4Q5VU57 503 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 VSIG1Q86XK7 387 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 TRIM58Q8NG06 486 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ACTL9Q8TC94 416 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 KLK6Q92876 244 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF599Q96NL3 588 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 GGT7Q9UJ14 662 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.71□□□□□ -0.05
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 MATN3O15232 486 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 GFRA3O60609 400 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 CCNB1P14635 433 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ITIH2P19823 946 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 OXTRP30559 389 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ABL2P42684 1182 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 NEK3P51956 506 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF33AQ06730 810 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SPEM2Q0P670 501 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 USP30Q70CQ3 517 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SLC35F6Q8N357 371 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TMIEQ8NEW7 156 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 TCEAL3Q969E4 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 AGAP3Q96P47 875 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 PSKH2Q96QS6 385 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SEMA3CQ99985 751 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 NOD2Q9HC29 1040 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.7□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 THADAQ6YHU6 1953 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 LRRC72A6NJI9 287 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 NEMP1O14524 444 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 KIF5CO60282 957 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 PCDH8O95206 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 APOC2P02655 101 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ADRB3P13945 408 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 CCNCP24863 283 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ITGB7P26010 798 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SERPINA4P29622 427 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 MPLP40238 635 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 RENBPP51606 427 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 COPS2P61201 443 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 NOMO1Q15155 1222 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 LAYNQ6UX15 382 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 C11orf74Q86VG3 221 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 MGME1Q9BQP7 344 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SGK2Q9HBY8 427 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 FSCN3Q9NQT6 498 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 FZD4Q9ULV1 537 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SCML1Q9UN30 329 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.69□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.68□□□□□ -0.06
PRDM15-216ENST00000496124 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms