RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TGFBIQ15582 683 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KIZQ2M2Z5 673 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TIGD2Q4W5G0 525 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 LIN9Q5TKA1 542 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP8Q86W28 1048 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZUFSPQ96AP4 578 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC51Q96ER9 411 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MSANTD3Q96H12 275 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MED15Q96RN5 788 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DCLK3Q9C098 648 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM105AQ9NUU6 356 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 STMN3Q9NZ72 180 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF98A6NK75 572 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 A6NL46 340 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR171O14626 319 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MEIS2O14770 477 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ALOX15BO15296 676 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP2AO43633 222 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MED24O75448 989 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS6KB1P23443 525 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HCAR3P49019 387 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GNG2P59768 71 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ABATP80404 500 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCZ1BP86790 482 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MGAT3Q09327 533 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PKP1Q13835 747 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MANEAQ5SRI9 462 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KREMEN2Q8NCW0 462 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NAT14Q8WUY8 206 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT35Q92764 455 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 P3H4Q92791 437 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM136AQ96C01 138 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC7Q99615 494 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPKQ9BS16 269 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 EPN3Q9H201 632 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 WWOXQ9NZC7 414 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS4AQ9UN37 437 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF175Q9Y473 711 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 MCM3APO60318 1980 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 GABBR2O75899 941 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB5P18084 799 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 CXCR2P25025 360 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 AVPR2P30518 371 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC14A1Q13336 389 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGGTB-213ENST00000496055 FIGNQ5HY92 759 aa4.63□□□□□ -1.67
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