RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PALB2Q86YC2 1186 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAAF1Q8NEP3 725 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GCC1Q96CN9 775 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MED30Q96HR3 178 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD180Q99467 661 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD93Q9NPY3 652 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM160Q9NX00 188 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBY3A6NI87 242 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITM2AO43736 263 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CXCR3P49682 368 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDLIM4P50479 330 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBE3AQ05086 875 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAPSQ13938 189 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAA25Q14CX7 972 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATG16L1Q676U5 607 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MON1AQ86VX9 555 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHD1LQ86WJ1 897 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPXM2Q8N436 756 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFWD2Q8NHY2 731 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM63Q969Q1 353 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF183Q96D59 192 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YME1L1Q96TA2 773 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EBAG9O00559 213 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP104O60308 925 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITGB8P26012 769 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RYKP34925 604 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIFRP42702 1097 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BNC1Q01954 994 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP43Q70EL4 1123 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOB3CQ70IA8 216 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UBXN10Q96LJ8 280 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC32A1Q9H598 525 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALKBH4Q9NXW9 302 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LUZP4Q9P127 313 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1B0GVM2 712 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R3DO95685 299 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRSS2P07478 247 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MXI1P50539 228 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BLKP51451 505 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST3GAL1Q11201 340 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASIC2Q16515 512 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q6ZTC4 211 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ELP4Q96EB1 424 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EYA3Q99504 573 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDT1Q9H211 546 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSF4Q9ULV5 492 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PROCRQ9UNN8 238 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 J3KR12 359 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRD5A1P18405 259 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYF6P23409 242 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP4A11Q02928 519 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF5AQ12840 1032 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAF2Q12933 501 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF667Q5HYK9 610 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RETSATQ6NUM9 610 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMO3Q8TAP4 145 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCLT1Q96NL6 688 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM51Q9NW97 253 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms