RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC36A4Q6YBV0 504 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SCD5Q86SK9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP76Q8TAP6 659 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC2A14Q8TDB8 520 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGB4Q8WW32 186 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TWNKQ96RR1 684 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ACOX2Q99424 681 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC7Q99615 494 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MED10Q9BTT4 135 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NMUR1Q9HB89 426 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HPSEQ9Y251 543 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP8B3O60423 1300 aa6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MROH6A6NGR9 719 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 AP5Z1O43299 807 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF217O75362 1048 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 GJB3O75712 270 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HLA-DRAP01903 254 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 KLKB1P03952 638 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NR3C1P04150 777 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MYL1P05976 194 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINF2P08697 491 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM200BP0CF97 657 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 P4HA1P13674 534 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CD59P13987 128 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TYRP14679 529 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF28P17035 718 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CMA1P23946 247 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ME1P48163 572 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PLP2Q04941 152 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF33AQ06730 810 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PKP1Q13835 747 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC30AQ86WT1 665 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB124Q8NES8 71 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CD244Q9BZW8 370 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CYP3A43Q9HB55 503 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 USP25Q9UHP3 1055 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TCHHQ07283 1943 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ITPR1Q14643 2758 aa6.67□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPRDP23468 1912 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 WASH3PC4AMC7 463 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 MDM4O15151 490 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 STC2O76061 302 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RHOBTB3O94955 611 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 IRF1P10914 325 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RARGP13631 454 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 HOXB2P14652 356 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAHP16930 419 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 WASP42768 502 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 VAMP7P51809 220 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF132P52740 706 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM193AP78312 1265 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP3CAQ08209 521 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 ANO4Q32M45 955 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB41Q5JT25 222 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms