RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TRIM24O15164 1050 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TTI1O43156 1089 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RAD51CO43502 376 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SERPINF2P08697 491 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ITIH2P19823 946 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MCM3P25205 808 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA6P43360 314 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SOX9P48436 509 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GEMP55040 296 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GDF10P55107 478 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB17Q13105 803 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MPP3Q13368 585 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PON2Q15165 354 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DLG2Q15700 870 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PTPRNQ16849 979 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CARD16Q5EG05 197 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CNTD1Q8N815 330 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NETO2Q8NC67 525 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SEC14L1Q92503 715 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 UBXN4Q92575 508 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 AGAP3Q96P47 875 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 IER2Q9BTL4 223 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TMEM245Q9H330 911 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NT5MQ9NPB1 228 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 WHRNQ9P202 907 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ASIC3Q9UHC3 531 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.86□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 WASH3PC4AMC7 463 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 INSIG1O15503 277 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LILRB5O75023 590 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ATG13O75143 517 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MT-CO1P00395 513 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 EPOP01588 193 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HLA-DQB2P05538 268 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CR2P20023 1033 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 KCNA4P22459 653 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NTSR1P30989 418 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ADCY8P40145 1251 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA9P43362 315 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 GPS1Q13098 491 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CALCOCO2Q13137 446 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SEMA5AQ13591 1074 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CCINQ13939 588 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZNF234Q14588 700 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ACCSLQ4AC99 568 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ARMC3Q5W041 872 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DUPD1Q68J44 220 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TXNDC11Q6PKC3 985 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LINGO4Q6UY18 593 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LINC00523Q86TU6 105 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HOOK3Q86VS8 718 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CCDC110Q8TBZ0 833 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FRS2Q8WU20 508 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TADA1Q96BN2 335 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SNF8Q96H20 258 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 MYO19Q96H55 970 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 LHX3Q9UBR4 397 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.85□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 E7EVH7 732 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 SOCS5O75159 536 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 NFKB1P19838 968 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TPSB2P20231 275 aa11.84□□□□□ -0.51
NISCH-211ENST00000488243 TGM1P22735 817 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms