RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD62A6NC57 917 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC53A6NM62 1247 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM38O00635 465 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ALOX15BO15296 676 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SNAP91O60641 907 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SRGAP2O75044 1071 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 FSBPO95073 299 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SRCP12931 536 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 VAV1P15498 845 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CKMT2P17540 419 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 DESP17661 470 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 TNFAIP3P21580 790 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 GPD1P21695 349 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 C5AR1P21730 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ACP1P24666 158 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 OR1E1P30953 314 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC8A1P32418 973 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ADRA1BP35368 520 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 LSSP48449 732 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 PSMD8P48556 350 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 HDAC4P56524 1084 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CYP4F2P78329 520 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 TEAD4Q15561 434 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 TGIF1Q15583 401 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 DLG2Q15700 870 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ASIC2Q16515 512 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB6CQ53S08 254 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ARTNQ5T4W7 220 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 MANEALQ5VSG8 457 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR59Q6PJI9 974 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 Q6ZVU0 165 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 LUZP1Q86V48 1076 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 NTAN1Q96AB6 310 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 MCEEQ96PE7 176 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 OMDQ99983 421 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SYT11Q9BT88 431 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CBX8Q9HC52 389 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS51Q9UID3 782 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SATB2Q9UPW6 733 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RP1P56715 2156 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A0D9SEW6 157 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PR77 199 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC72A6NJI9 287 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 MCF2LO15068 1137 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CCP110O43303 1012 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 SIGLEC6O43699 453 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 NOBOXO60393 691 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CSO75390 466 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 MT-CO1P00395 513 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 IL1BP01584 269 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CDK4P11802 303 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RHOQP17081 205 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 GOT1P17174 413 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RRM1P23921 792 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 CD27P26842 260 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 DRD3P35462 400 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ETFBP38117 255 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 PRKCIP41743 596 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 MAPKAPK2P49137 400 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 GALCP54803 685 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 ADPRHP54922 357 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDSPL-208ENST00000486978 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms