RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MAPK13	O15264	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBL1X	O60907	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MYL1	P05976	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ALPPL2	P10696	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	C5AR1	P21730	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NR2F2	P24468	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ITPKB	P27987	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GTF2H1	P32780	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PGF	P49763	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TKTL1	P51854	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GALC	P54803	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CXADR	P78310	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RHD	Q02161	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CFHR1	Q03591	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ENPEP	Q07075	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	OVGP1	Q12889	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CUL4A	Q13619	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RTP5	Q14D33	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FXN	Q16595	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KRT39	Q6A163	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ATL3	Q6DD88	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRORY	Q9H606	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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