RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481739.1

RXRA-202, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RXRA, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-202ENST00000481739 CCL16O15467 120 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PLIN3O60664 434 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PRAMEF11O60813 436 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PMPCBO75439 489 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 LATS1O95835 1130 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TPH1P17752 444 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 KIAA0408Q6ZU52 694 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 DCLK2Q8N568 766 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CALML6Q8TD86 181 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TADA1Q96BN2 335 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GPR22Q99680 433 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 NPHS2Q9NP85 383 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 NT5MQ9NPB1 228 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PER2O15055 1255 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CLDN11O75508 207 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 APOA4P06727 396 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GRK2P25098 689 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ETFBP38117 255 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 38.4
RXRA-202ENST00000481739 LBRQ14739 615 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CHST9Q7L1S5 443 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 LGI2Q8N0V4 545 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PEX13Q92968 403 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 VPS39Q96JC1 886 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TREX1Q9NSU2 369 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 THAP1Q9NVV9 213 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 J3KR12 359 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 COCHO43405 550 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 EPOP01588 193 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 EPCAMP16422 314 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GABRR2P28476 465 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 OCRLQ01968 901 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 POU6F1Q14863 301 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CHI3L2Q15782 390 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CRLF3Q8IUI8 442 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 AGAP2Q99490 1192 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CORO1BQ9BR76 489 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TUBB6Q9BUF5 446 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.94■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 C2orf78A6NCI8 922 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 UNC5CO95185 931 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 F11P03951 625 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PROCP04070 461 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 COL6A2P12110 1019 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 RASSF2P50749 326 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 KCNQ1P51787 676 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ARFIP2P53365 341 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 BST1Q10588 318 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ZNF235Q14590 738 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GALNT7Q86SF2 657 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ERP27Q96DN0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GCNAQ96QF7 691 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CHKBQ9Y259 395 aa15.93■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 DNAJC6O75061 913 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 RFPL2O75678 378 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 SERPINE1P05121 402 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 MYL4P12829 197 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 HLA-DPA1P20036 260 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 CD86P42081 329 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 NCALDP61601 193 aa15.92■□□□□ 0.14
RXRA-202ENST00000481739 GNA12Q03113 381 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms