RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 DLL1O00548 723 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 LAMTOR5O43504 91 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 OPHN1O60890 802 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PRNPP04156 253 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 NFKB1P19838 968 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PAFAH1B1P43034 410 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FNTAP49354 379 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ZBTB16Q05516 673 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 DMWDQ09019 674 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ARSIQ5FYB1 569 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TSSK4Q6SA08 328 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CACUL1Q86Y37 369 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 GBA3Q9H227 469 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SCUBE2Q9NQ36 999 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN11A1L157 253 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ALDH1A2O94788 518 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PIGNO95427 931 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CES1P23141 567 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PSMD8P48556 350 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SKOR1P84550 965 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PID1Q7Z2X4 250 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 AADATQ8N5Z0 425 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SPOCK2Q92563 424 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 NELL1Q92832 810 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 MID1O15344 667 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 NEBLO76041 1014 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ADH1BP00325 375 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 IL1BP01584 269 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 IGLV3-19P01714 112 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 UGT2B4P06133 528 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 C5AR1P21730 350 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SLC8A1P32418 973 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 DRD3P35462 400 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 NUBP1P53384 320 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ITKQ08881 620 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TRAF2Q12933 501 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 GRM3Q14832 879 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SLC14A2Q15849 920 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 P3H1Q32P28 736 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ATL2Q8NHH9 583 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SLCO2A1Q92959 643 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ARRDC3Q96B67 414 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FCRL5Q96RD9 977 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CD93Q9NPY3 652 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CCDC188H7C350 402 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 SOCS5O75159 536 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ETS1P14921 441 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ITGB7P26010 798 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 CD86P42081 329 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 RAD51Q06609 339 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 TUBB2AQ13885 445 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.15■□□□□ 0.82
ACTB-210ENST00000477812 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.15■□□□□ 0.82
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