RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-208ENST00000477447 TSPYL6Q8N831 410 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ASB5Q8WWX0 329 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KLHL29Q96CT2 875 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KLHL15Q96M94 604 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 YME1L1Q96TA2 773 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MVB12BQ9H7P6 319 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PREBQ9HCU5 417 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KIAA1456Q9P272 454 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 HSPB7Q9UBY9 170 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SARDHQ9UL12 918 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.51□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MYMKA6NI61 221 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MS4A18H0YCH9 400 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 I6L893 689 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 EBAG9O00559 213 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 LDLRAD4O15165 306 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SPTLC2O15270 562 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 LDB2O43679 373 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 LIASO43766 372 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TFPIP10646 304 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 COX7A2P14406 83 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ELF1P32519 619 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TTKP33981 857 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 THPOP40225 353 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CENPAP49450 140 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 EFNA5P52803 228 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZP1P60852 638 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CYP4A11Q02928 519 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TRAF1Q13077 416 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 VEPH1Q14D04 833 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TAF11Q15544 211 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF284Q2VY69 593 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ATG9BQ674R7 924 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 AWAT2Q6E213 333 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF549Q6P9A3 640 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 Q6ZSV7 163 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 DENND6AQ8IWF6 608 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KIAA2013Q8IYS2 634 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MIGA1Q8NAN2 632 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZMIZ2Q8NF64 920 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 NFKBIDQ8NI38 313 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KCND2Q9NZV8 630 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MPP6Q9NZW5 540 aa3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CD8B2A6NJW9 211 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 HSPB2A8KAH6 182 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 BECN2A8MW95 431 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TNFSF14O43557 240 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MBD4O95243 580 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 TBX18O95935 607 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CBSLP0DN79 551 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PCNAP12004 261 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PTPN2P17706 415 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CDC25AP30304 524 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ABCD1P33897 745 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CBSP35520 551 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PMS2P54278 862 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CASP6P55212 293 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CLDN2P57739 230 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MPP1Q00013 466 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 FAM27E3Q08E93 113 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 LPIN1Q14693 890 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 HSPB2Q16082 182 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 RBFAQ8N0V3 343 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MCPH1Q8NEM0 835 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 GPT2Q8TD30 523 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MPP4Q96JB8 637 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 BBS4Q96RK4 519 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 CDT1Q9H211 546 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TARDBP-208ENST00000477447 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms