RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463675.5

SNU13-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein 13, human

TSL 3

Gene SNU13, Length 786 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNU13-205	ENST00000463675	ZNF235	Q14590	738 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PDK2	Q15119	407 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TCEAL1	Q15170	157 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LLGL1	Q15334	1064 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	KIAA1328	Q86T90	577 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	FAF2	Q96CS3	445 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	HDAC8	Q9BY41	377 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	FZD3	Q9NPG1	666 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675		A0A1W2PPC4	97 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675		A0A1W2PQU0	124 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SLC30A4	O14863	429 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	WNT9A	O14904	365 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SPINT1	O43278	529 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PCDH8	O95206	1070 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	KDELR1	P24390	212 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	CCR5	P51681	352 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	DYNLT1	P63172	113 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	BNC1	Q01954	994 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PLPP6	Q8IY26	295 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SERAC1	Q96JX3	654 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PREB	Q9HCU5	417 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	C10orf142	B7Z368	130 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ARHGAP33	O14559	1287 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LAT	O43561	262 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MAFK	O60675	156 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PEX11B	O96011	259 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SLC1A1	P43005	524 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	VAV2	P52735	878 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MAX	P61244	160 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	GALNT2	Q10471	571 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ODF2	Q5BJF6	829 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	DAAM2	Q86T65	1068 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TRIM69	Q86WT6	500 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RFX6	Q8HWS3	928 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PGBD5	Q8N414	524 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	KRT35	Q92764	455 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SEPT3	Q9UH03	358 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ALG6	Q9Y672	507 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SLC31A1	O15431	190 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PSTPIP1	O43586	416 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	WNT1	P04628	370 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PRKCG	P05129	697 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ITIH2	P19823	946 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LIMK1	P53667	647 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SEMG2	Q02383	582 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RAD51	Q06609	339 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	KIF19	Q2TAC6	998 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	CFAP58	Q5T655	872 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LRRC38	Q5VT99	294 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	NPNT	Q6UXI9	565 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	SRL	Q86TD4	932 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	HORMAD1	Q86X24	394 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PAF1	Q8N7H5	531 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	PLD5	Q8N7P1	536 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SNU13-205	ENST00000463675	RNF157	Q96PX1	679 aa		15.36	■□□□□ 0.05

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