RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 PDK1Q15118 436 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 NOMO1Q15155 1222 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 TSGA13Q96PP4 275 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.56□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 MATN3O15232 486 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 TMCC1O94876 653 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 CCNCP24863 283 aa8.55□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 EOGTQ5NDL2 527 aa8.55□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.55□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 HACD1B0YJ81 288 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 NPC1O15118 1278 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 INSIG1O15503 277 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 ATG13O75143 517 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 SIN3BO75182 1162 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 GJB3O75712 270 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 BMP4P12644 408 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 HOXB2P14652 356 aa8.54□□□□□ -1.04
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ANKRD28-208ENST00000463533 RGRP47804 291 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 CLCN5P51795 746 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 NRLP54845 237 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 MAXP61244 160 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 CTBSQ01459 385 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB17Q13105 803 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 XRCC4Q13426 336 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF235Q14590 738 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 E2F5Q15329 346 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD28-208ENST00000463533 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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