RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 AURKAO14965 403 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 POLD2P49005 469 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 AQP4P55087 323 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ZNF280DQ6N043 979 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SERINC5Q86VE9 423 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 IFT43Q96FT9 208 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CDRT15Q96T59 188 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TREX1Q9NSU2 369 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PDP2Q9P2J9 529 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 STK39Q9UEW8 545 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CEP350Q5VT06 3117 aa20.69■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 H3BNX3 289 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 M0QZQ0 153 aa20.68■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 DNAJB1P25685 340 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 SH2D4BQ5SQS7 431 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 C14orf80Q86SX3 495 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RNF135Q8IUD6 432 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.68■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 POMKQ9H5K3 350 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 OR4Q2P0C623 313 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 HTR7P34969 479 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CSHL1Q14406 222 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NEPROQ6NW34 567 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CNSTQ6PJW8 725 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RANBP10Q6VN20 620 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SCD5Q86SK9 330 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 TRPV1Q8NER1 839 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 FIS1Q9Y3D6 152 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SCN4AP35499 1836 aa20.68■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 A0A087X1B8 175 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NEMP2A6NFY4 417 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 KPNA6O60684 536 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CPB1P15086 417 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 TUSC3Q13454 348 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 NMUR1Q9HB89 426 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 A0A1W2PQH9 124 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PKNOX1P55347 436 aa20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 ITKQ08881 620 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 MED21Q13503 144 aa20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 PIDD1Q9HB75 910 aa20.67■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.67■□□□□ 0.9
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IMP4-208ENST00000460766 RAB27AP51159 221 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ART3Q13508 389 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 ARTNQ5T4W7 220 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 RNF148Q8N7C7 305 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
IMP4-208ENST00000460766 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.66■□□□□ 0.9
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