RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	VHL	P40337	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM32	Q13049	653 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SERINC3	Q13530	473 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SEPT6	Q14141	434 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMD5	Q16401	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FUT10	Q6P4F1	479 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	KDELC1	Q6UW63	502 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	EPGN	Q6UW88	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	AGAP2	Q99490	1192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NACA2	Q9H009	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MTMR11	A4FU01	709 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758		G3V2L1	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ENPP3	O14638	875 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CLDN11	O75508	207 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	AHSG	P02765	367 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TPH1	P17752	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	OR1E1	P30953	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	IDH3A	P50213	366 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RABGGTB	P53611	331 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CDH4	P55283	916 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TAF10	Q12962	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	HERC3	Q15034	1050 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ACAP2	Q15057	778 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF12	Q99081	682 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SORT1	Q99523	831 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	UBP1	Q9NZI7	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	MATN2	O00339	956 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D4	O60343	1298 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	TLR5	O60602	858 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMG1	O95456	288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	GLP2R	O95838	553 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TTLL3-222	ENST00000459758	INHA	P05111	366 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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