RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 KLHL32Q96NJ5 620 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ENC1O14682 589 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PRPSAP2O60256 369 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PTMSP20962 102 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RHOAP61586 193 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 OR13H1Q8NG92 308 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC39A8Q9C0K1 460 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 AKAP13Q12802 2813 aa24.35■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 USP24Q9UPU5 2620 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LRCH4O75427 683 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 IGSF6O95976 241 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CAPNS1P04632 268 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBED6P86452 979 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TTC7BQ86TV6 843 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ASB12Q8WXK4 309 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PDFQ9HBH1 243 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LHX3Q9UBR4 397 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TRPM6Q9BX84 2022 aa24.34■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 IGLON5A6NGN9 336 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 J3KR12 359 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 AREL1O15033 823 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RAD51BO15315 384 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SPINT1O43278 529 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ERCC2P18074 760 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 HCAR3P49019 387 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SGCGQ13326 291 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ACAP1Q15027 740 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 Q6ZSR6 202 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RFX8Q6ZV50 586 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 IQCDQ96DY2 449 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CALN1Q9BXU9 219 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 DKK3Q9UBP4 350 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 GGT7Q9UJ14 662 aa24.33■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 POM121BA6NF01 834 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 A6NNZ2 444 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 NEMP1O14524 444 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 INSIG1O15503 277 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 DAPK3O43293 454 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 PRAMEF11O60813 436 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 SERPING1P05155 500 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 PCK1P35558 622 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 AFMIDQ63HM1 303 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC25A45Q8N413 288 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 TSC1Q92574 1164 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 IFT43Q96FT9 208 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 GPR27Q9NS67 375 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ITM2BQ9Y287 266 aa24.32■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 SDC3O75056 442 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 C1SP09871 688 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 TIMP2P16035 220 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 DNAJC3Q13217 504 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC157Q569K6 752 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 DHRS13Q6UX07 377 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS36Q86VN1 386 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 IFNKQ9P0W0 207 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRBP23467 1997 aa24.31■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 DGKAP23743 735 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 BOLA3Q53S33 107 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 EXOC2Q96KP1 924 aa24.3■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 FPGTO14772 594 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 CDK4P11802 303 aa24.29■■□□□ 1.48
PPP1CB-208ENST00000455580 ITIH2P19823 946 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms