RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DOCK1Q14185 1865 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 KLHL33A6NCF5 533 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TRABD2BA6NFA1 517 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 A8MV72 311 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM232C9JQI7 657 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 H0Y9J4 135 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 H0YAA0 97 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 QSOX1O00391 747 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PPM1DO15297 605 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TGFB1I1O43294 461 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DHHO43323 396 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PRC1O43663 620 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 JAK2O60674 1132 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PRSS23O95084 383 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 RASGRP1O95267 797 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 IFNW1P05000 195 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 KRT7P08729 469 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CLTAP09496 248 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 P0C880 135 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 HLA-EP13747 358 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TCF3P15923 654 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SRD5A1P18405 259 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GCSHP23434 173 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TECP42680 631 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 NASPP49321 788 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 NXPH1P58417 271 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 RAE1P78406 368 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 NDPQ00604 133 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 B4GALNT1Q00973 533 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DEFA5Q01523 94 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CREB5Q02930 508 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FAM160A1Q05DH4 1040 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PPP3CAQ08209 521 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SEMA3BQ13214 749 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ART3Q13508 389 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TRIM14Q14142 442 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FZD2Q14332 565 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GRM4Q14833 912 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GPNMBQ14956 572 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PRSS53Q2L4Q9 553 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SNAI3Q3KNW1 292 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DCST1Q5T197 706 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GARNL3Q5VVW2 1013 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FAM219BQ5XKK7 198 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ANKRD16Q6P6B7 361 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 KCNT2Q6UVM3 1135 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 Q6ZRU5 148 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GK5Q6ZS86 529 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FAM196AQ6ZSG2 479 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 MAVSQ7Z434 540 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 WDR63Q8IWG1 891 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF645Q8N7E2 425 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PRR26Q8N8Z3 221 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PIK3C3Q8NEB9 887 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DMBX1Q8NFW5 382 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ASB15Q8WXK1 588 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 KAT2AQ92830 837 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SLCO2A1Q92959 643 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FEM1CQ96JP0 617 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 LGMNQ99538 433 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 IL25Q9H293 177 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ADNPQ9H2P0 1102 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 IKZF5Q9H5V7 419 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 CYP26B1Q9NR63 512 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 HIF1ANQ9NWT6 349 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 GPR83Q9NYM4 423 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 EHD3Q9NZN3 535 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 FAM30AQ9NZY2 134 aa-0.49□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 HSFX1Q9UBD0 423 aa-0.49□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms