RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GSRP00390 522 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CALB1P05937 261 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NME1P15531 152 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 GPD1P21695 349 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RABIFP47224 123 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.738e-7■■■■□ 22.2
SH3BP4-206ENST00000446904 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC73Q5JTD7 316 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PARGQ86W56 976 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 PLPP6Q8IY26 295 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NEK11Q8NG66 645 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM174AQ8TBP5 190 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NTAN1Q96AB6 310 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL32Q96NJ5 620 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 SELENOOQ9BVL4 669 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KLC2Q9H0B6 622 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 RETREG1Q9H6L5 497 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 KLF15Q9UIH9 416 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 U3KQA8 63 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 LGALS16A8MUM7 142 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 H3BM21 787 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 AREL1O15033 823 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RRP8O43159 456 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CCP110O43303 1012 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 MMP20O60882 483 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CSF2P04141 144 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 JUNDP17535 347 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ITIH2P19823 946 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 EPHB2P29323 1055 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ACTN2P35609 894 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 UBXN1Q04323 297 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 EFHC2Q5JST6 749 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 DNAJC24Q6P3W2 148 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 SLFN11Q7Z7L1 901 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC7BQ86TV6 843 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS36Q86VN1 386 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSCAN30Q86W11 494 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 C3orf20Q8ND61 904 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 LMX1AQ8TE12 382 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 FGF11Q92914 225 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB7BQ96AH8 199 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 HMCESQ96FZ2 354 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCG4Q9H172 646 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RAI2Q9Y5P3 530 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 MYLKQ15746 1914 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 MGAQ8IWI9 3026 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CPED1A4D0V7 1026 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD62A6NC57 917 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RASA4BC9J798 803 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 INSIG1O15503 277 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 AQP9O43315 295 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RASA4O43374 803 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CREB3O43889 395 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CSO75390 466 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 IGSF6O95976 241 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 MPOP05164 745 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMP2P16035 220 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 PFN3P60673 137 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RHOAP61586 193 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKN3Q16667 212 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 DEFB133Q30KQ1 61 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 MON1BQ7L1V2 547 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 RBFAQ8N0V3 343 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP4-206ENST00000446904 IFI44Q8TCB0 444 aa10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms