RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440001.2

TRAF3IP2-AS1-203, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 915 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF354CQ86Y25 554 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NETO2Q8NC67 525 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IFT43Q96FT9 208 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KLHL32Q96NJ5 620 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TTYH3Q9C0H2 523 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DSPP15924 2871 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IGLON5A6NGN9 336 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 AREL1O15033 823 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ACP1P24666 158 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SERINC3Q13530 473 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PARP15Q460N3 678 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HES3Q5TGS1 186 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR4C6Q8NH72 309 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RAXQ9Y2V3 346 aa27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LRRK1Q38SD2 2015 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TMCO5BA8MYB1 307 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 JUPP14923 745 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HNF1BP35680 557 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FZD2Q14332 565 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GDPD4Q6W3E5 623 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DNAAF5Q86Y56 855 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ASB12Q8WXK4 309 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LHX6Q9UPM6 363 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LAMA5O15230 3695 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SMTNL1A8MU46 457 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RHOAP61586 193 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF542PQ5EBM4 170 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HAUS4Q9H6D7 363 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LRRC19Q9H756 370 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PARVAQ9NVD7 372 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 AIPL1Q9NZN9 384 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LHX3Q9UBR4 397 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CACNA1GO43497 2377 aa27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 A0A1W2PQC6 194 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NEMP1O14524 444 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FFAR2O15552 330 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IGSF6O95976 241 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PSMA2P25787 234 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HTR7P34969 479 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RABIFP47224 123 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TPI1P60174 286 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SGCGQ13326 291 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CYTH1Q15438 398 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ASIC2Q16515 512 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CA9Q16790 459 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LRRC73Q5JTD7 316 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TPRG1LQ5T0D9 272 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KDM7AQ6ZMT4 941 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DENND6BQ8NEG7 585 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RFFLQ8WZ73 363 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ARHGEF26Q96DR7 871 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DNAJC28Q9NX36 388 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 AP4E1Q9UPM8 1137 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 A0A1B0GTH6 734 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FPGTO14772 594 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DESP17661 470 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRKCIP41743 596 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF165P49910 485 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RAD51Q06609 339 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FILIP1LQ4L180 1135 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PEBP4Q96S96 227 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TRIM7Q9C029 511 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PDFQ9HBH1 243 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ANKRD36A6QL64 1941 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 INSIG1O15503 277 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GZMAP12544 262 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PFN3P60673 137 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C19orf48Q6RUI8 117 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TTC7BQ86TV6 843 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PARGQ86W56 976 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CENPTQ96BT3 561 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 EXOC2Q96KP1 924 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FUCA2Q9BTY2 467 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NLGN3Q9NZ94 848 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DKK3Q9UBP4 350 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KLF15Q9UIH9 416 aa27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TMEM191CA6NGB0 347 aa27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms