RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SPTA1	P02549	2419 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	NEMP1	O14524	444 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	YY2	O15391	372 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CD160	O95971	181 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	F9	P00740	461 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ANXA6	P08133	673 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	KRT9	P35527	623 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	GNA12	Q03113	381 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PAK1	Q13153	545 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	MORC3	Q14149	939 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TBATA	Q96M53	351 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FAM117A	Q9C073	453 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CLPB	Q9H078	707 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	BIN1	O00499	593 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PLD2	O14939	933 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TSHR	P16473	764 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	IGFALS	P35858	605 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CSRP3	P50461	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	YPEL5	P62699	121 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PLPP6	Q8IY26	295 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	AREL1	O15033	823 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	UGT2B4	P06133	528 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SLC5A2	P31639	672 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CLCN1	P35523	988 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FLT3	P36888	993 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	ACVRL1	P37023	503 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TGIF1	Q15583	401 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	MACC1	Q6ZN28	852 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LRP4	O75096	1905 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	KRIT1	O00522	736 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	NOBOX	O60393	691 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	MMP20	O60882	483 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	TM7SF2	O76062	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	GJB6	O95452	261 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PON1	P27169	355 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	UGT1A5	P35504	534 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SCNN1A	P37088	669 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	GABRB2	P47870	512 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	PPARD	Q03181	441 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	USP53	Q70EK8	1073 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	JAML	Q86YT9	394 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB17-208	ENST00000430445	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.96	□□□□□ -0.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms