RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 C4orf47A7E2U8 309 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 ZNF487B1APH4 448 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 ARHGAP33O14559 1287 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 PJA2O43164 708 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 LATO43561 262 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 PSTPIP1O43586 416 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 PIGNO95427 931 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 PEX11BO96011 259 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 SYPP08247 313 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 TRIM69Q86WT6 500 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 DLL3Q9NYJ7 618 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQU0 124 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 SLC30A4O14863 429 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 MUSKO15146 869 aa18.25■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 RFX6Q8HWS3 928 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 RAB7BQ96AH8 199 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 CFAP54Q96N23 3096 aa18.25■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 A0A1B0GVT2 93 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 GRIA4P48058 902 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 SCNN1BP51168 640 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 RACK1P63244 317 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 BBS5Q8N3I7 341 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 TXLNBQ8N3L3 684 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 PLD5Q8N7P1 536 aa18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 GON4LQ3T8J9 2241 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 APOL1O14791 398 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 WNT9AO14904 365 aa18.23■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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HERC3-205ENST00000426683 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 PGBD5Q8N414 524 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 OR2I1PQ8NGU4 316 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 KLK6Q92876 244 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa18.23■□□□□ 0.51
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