RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KIFC1Q9BW19 673 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SPC25Q9HBM1 224 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 VCX3AQ9NNX9 186 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MIOSQ9NXC5 875 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT9Q9Y305 439 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 EML3Q32P44 896 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM35AQ86V20 835 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRA2Q8N149 483 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 IPMKQ8NFU5 416 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PCED1BQ96HM7 432 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CNBD2Q96M20 576 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 VAT1Q99536 393 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DFFAO00273 331 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MGEA5O60502 916 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM18P0DKX4 95 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AXLP30530 894 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF34Q969K3 372 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 NOD1Q9Y239 953 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TARM1B6A8C7 271 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 F8W810 466 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRDO14764 452 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CRTAMO95727 393 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ME2P23368 584 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GK3PQ14409 553 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP8Q96LD8 212 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CREBZFQ9NS37 354 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH23Q9H251 3354 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 C9IYK1 514 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QZ92 97 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HAPLN3Q96S86 360 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PKP2Q99959 881 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 APPL1Q9UKG1 709 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 STMN1P16949 149 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SCNN1GP51170 649 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAA2P54646 552 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB10P61026 200 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 29.7
SH3BP1-202ENST00000417536 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00523Q86TU6 105 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA24Q86W54 205 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SIK2Q9H0K1 926 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9H521 79 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ETAA1Q9NY74 926 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GTSE1Q9NYZ3 720 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 POMCP01189 267 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HK2P52789 917 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 PCID2Q5JVF3 399 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM1BQ8NB78 822 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL32Q96NJ5 620 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS28Q9UK41 221 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AK5Q9Y6K8 562 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 NEMP2A6NFY4 417 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 AP1G1O43747 822 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ARSAP15289 507 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF280DQ6N043 979 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GK5Q6ZS86 529 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RAET1EQ8TD07 263 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 DPF3Q92784 378 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.8 ms