RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380232.3

IFNB1-201, Transcript of interferon beta 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IFNB1, Length 859 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1-201ENST00000380232 TARM1B6A8C7 271 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 LIPAP38571 399 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 ALDH9A1P49189 494 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TFF2Q03403 129 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 STIM1Q13586 685 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 UNC13DQ70J99 1090 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 GPBP1Q86WP2 473 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PIGOQ8TEQ8 1089 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 NLRP4Q96MN2 994 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 GSDMAQ96QA5 445 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 RNF7Q9UBF6 113 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 HPSEQ9Y251 543 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 H0YIZ8 118 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 K7ERI5 159 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 ACKR2O00590 384 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 AP1G1O43747 822 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TLR5O60602 858 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CELA2AP08217 269 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 FAM163BP0C2L3 166 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PFKFB1P16118 471 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CLCN3P51790 818 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 ENPEPQ07075 957 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PKP1Q13835 747 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 MYBPC2Q14324 1141 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 KCNB1Q14721 858 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 IL17AQ16552 155 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SHC4Q6S5L8 630 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CD302Q8IX05 232 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 FSIP1Q8NA03 581 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 BADQ92934 168 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 DHX58Q96C10 678 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 EPSTI1Q96J88 318 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TRIM9Q9C026 710 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 RGS18Q9NS28 235 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 EXOC1Q9NV70 894 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PADI3Q9ULW8 664 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CENPFP49454 3210 aa6.6□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 MYH11P35749 1972 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 A0A0U1RQF3 1178 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CCDC169A6NNP5 214 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PP2D1A8MPX8 630 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 E9PMD0 336 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 H0YGN5 161 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 K7ENM7 598 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 TOM1L1O75674 476 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PIGRP01833 764 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CHRNA1P02708 482 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 VTNP04004 478 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PRKCBP05771 671 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 GHRP10912 638 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CSF2RAP15509 400 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 GLRA2P23416 452 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CYP2C18P33260 490 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PPM1AP35813 382 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PEX3P56589 373 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 ASIC1P78348 528 aa6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
IFNB1-201ENST00000380232 CAPSQ13938 189 aa6.59□□□□□ -1.35
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