RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.78■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 MFAP3LO75121 409 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 TMEM253P0C7T8 217 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 RARAP10276 462 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 IL1R2P27930 398 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 MAN1A1P33908 653 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 SERPINB6P35237 376 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 ARHGAP25P42331 645 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 GRK6P43250 576 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 NUMBP49757 651 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 RENBPP51606 427 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 NXPH1P58417 271 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 PPP2CBP62714 309 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 PPP2CAP67775 309 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 CA9Q16790 459 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 ZNF284Q2VY69 593 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 DEFB124Q8NES8 71 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 CCDC42Q96M95 316 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 SLC6A18Q96N87 628 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 SLC39A8Q9C0K1 460 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 DEF6Q9H4E7 631 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa15.77■□□□□ 0.12
NSL1-201ENST00000366976 A0A1W2PQ67 120 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 A0A1W2PQU0 124 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 TSPAN11A1L157 253 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CFAP69A5D8W1 941 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 FAM221BA6H8Z2 402 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ZNF487B1APH4 448 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 AREL1O15033 823 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 AKR1B10O60218 316 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 MTA2O94776 668 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PROSCO94903 275 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 KRT7P08729 469 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CDK4P11802 303 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 AKT2P31751 481 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 RHOAP61586 193 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PDK2Q15119 407 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CYTH1Q15438 398 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 TSC1Q92574 1164 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 FATE1Q969F0 183 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PSKH2Q96QS6 385 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 TM6SF2Q9BZW4 377 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 WASF3Q9UPY6 502 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.76■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 KRIT1O00522 736 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 SH3BP5O60239 455 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 WNT1P04628 370 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ELP6Q0PNE2 266 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 IL21RQ9HBE5 538 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 LHX3Q9UBR4 397 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 METRNQ9UJH8 293 aa15.75■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 KNL1Q8NG31 2342 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 H0Y8X5 98 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PLK4O00444 970 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 GIPC1O14908 333 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PALMO75781 387 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 DKK1O94907 266 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 PCDH8O95206 1070 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 IL4RP24394 825 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 ARSEP51690 589 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 SGCGQ13326 291 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 AGERQ15109 404 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.74■□□□□ 0.11
NSL1-201ENST00000366976 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms