RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 MTTPP55157 894 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 COG7P83436 770 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPY1Q01534 308 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 AGR3Q8TD06 166 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SUSD3Q96L08 255 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PKMYT1Q99640 499 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARVCFO00192 962 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CLGNO14967 610 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNCP24863 283 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAA2P54646 552 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ASPHQ12797 758 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS1R1Q7RTX1 841 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MFN1Q8IWA4 741 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 COLGALT2Q8IYK4 626 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ABI1Q8IZP0 508 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CASP10Q92851 521 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CNDP1Q96KN2 507 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SZT2Q5T011 3432 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TARM1B6A8C7 271 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC3O15379 428 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CSPG5O95196 566 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL17P18621 184 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIA4P48058 902 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 HK2P52789 917 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PGGT1BP53609 377 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PCID2Q5JVF3 399 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 THEM5Q8N1Q8 247 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 STYXQ8WUJ0 223 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 EBF3Q9H4W6 596 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV3-25P01717 112 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CD1EP15812 388 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SCML4Q8N228 414 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MYLKQ15746 1914 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQH9 124 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 HMBSP08397 361 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 COL6A2P12110 1019 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB1P25685 340 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 XIAPP98170 497 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC12A1Q13621 1099 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM26DQ5JW98 314 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DENND5AQ6IQ26 1287 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB3Q8N7B9 438 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GBP5Q96PP8 586 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FCRL5Q96RD9 977 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TBL1YQ9BQ87 522 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSS2Q9NR19 701 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MPP6Q9NZW5 540 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA8OA6NCC3 632 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA8NF8WBI6 632 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ENPP3O14638 875 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 GRID2O43424 1007 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGNO95427 931 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 TFEBP19484 476 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SAT1P21673 171 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2C18P33260 490 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 CCR10P46092 362 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP2R5DQ14738 602 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 SEL1L3Q68CR1 1132 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 ACAD11Q709F0 780 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 IL12RB2Q99665 862 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 34.7
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 DFFAO00273 331 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP1-201ENST00000357436 THRAP10827 490 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms