RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 HEATR9A2RTY3 570 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CBX4O00257 560 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 GLRA3O75311 464 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 AHSGP02765 367 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PRKCGP05129 697 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 C8AP07357 584 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 GJA1P17302 382 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RGRP47804 291 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MPP1Q00013 466 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 FSCBQ5H9T9 825 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CES4AQ5XG92 561 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CARNMT1Q8N4J0 409 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RANBP9Q96S59 729 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TCF25Q9BQ70 676 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ZNF358Q9NW07 568 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SEPT3Q9UH03 358 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TIMM44O43615 452 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 GSRP00390 522 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 BPGMP07738 259 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 LIG3P49916 1009 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CYTH1Q15438 398 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 STXBP5Q5T5C0 1151 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RNF43Q68DV7 783 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZNB5 142 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RNF135Q8IUD6 432 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CNTN4Q8IWV2 1026 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 IFT43Q96FT9 208 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MGME1Q9BQP7 344 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MUC3BQ9H195 1237 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 NPHS2Q9NP85 383 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 KCTD3Q9Y597 815 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 HIDE1A8MVS5 230 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PLIN3O60664 434 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ADH1AP07327 375 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PAMP19021 973 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PGGT1BP53609 377 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 C1QTNF8P60827 252 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CDK18Q07002 472 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CHI3L2Q15782 390 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 BBS5Q8N3I7 341 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A17Q8WUG5 538 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 E2F7Q96AV8 911 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 FEM1CQ96JP0 617 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 EXOC2Q96KP1 924 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RAD9AQ99638 391 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 NOD2Q9HC29 1040 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 A0A096LPK6 155 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 H0Y626 953 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 KLF11O14901 512 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 HGSO14964 777 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CCL16O15467 120 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SNAP91O60641 907 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SIN3BO75182 1162 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 LATS1O95835 1130 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 C1RP00736 705 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MPOP05164 745 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MYL4P12829 197 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB1P25685 340 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SLC1A2P43004 574 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 IRF9Q00978 393 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 GALNT3Q14435 633 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ALG1LQ6GMV1 187 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RFWD2Q8NHY2 731 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 C10orf82Q8WW14 230 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 BHMTQ93088 406 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PSKH2Q96QS6 385 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 GPR22Q99680 433 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 RHOJQ9H4E5 214 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PRU2 124 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 MROH6A6NGR9 719 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 CCL22O00626 93 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 BIRC5O15392 142 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 PROCP04070 461 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SERPINF2P08697 491 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-201ENST00000331789 SAT1P21673 171 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms