RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ZNF384Q8TF68 577 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CCDC126Q96EE4 140 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 NODALQ96S42 347 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 WDR18Q9BV38 432 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CD320Q9NPF0 282 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 HADHAP40939 763 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 NAB1Q13506 487 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 IPMKQ8NFU5 416 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A3Q9BRY0 314 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 INIPQ9NRY2 104 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB14O43829 449 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 NAT1P18440 290 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 BNIP2Q12982 314 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 STILQ15468 1287 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC51AQ86UW1 340 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 HDAC10Q969S8 669 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CABYRO75952 493 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CFHP08603 1231 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 COLEC12Q5KU26 742 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 EID3Q8N140 333 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC29A1Q99808 456 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TK2O00142 265 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 PRKACBP22694 351 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC13A2Q13183 592 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ENKURQ8TC29 256 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 PDE10AQ9Y233 779 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CPOXP36551 454 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SP8Q8IXZ3 490 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 COA1Q9GZY4 146 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 AP1G1O43747 822 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TOMM70O94826 608 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 DLG2Q15700 870 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CA9Q16790 459 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZNF544Q6NX49 715 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 LMO3Q8TAP4 145 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SIAEQ9HAT2 523 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 POLLQ9UGP5 575 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ADAM23O75077 832 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 THRBP10828 461 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 HLA-DPA1P20036 260 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 OPRL1P41146 370 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CRKP46108 304 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZACNQ401N2 412 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 EPGNQ6UW88 154 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SNX29P2Q8IUI4 249 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 NETO2Q8NC67 525 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 SETD9Q8NE22 299 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 A0A1B0GTW7 788 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 TSPAN4O14817 238 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-201ENST00000320580 CDH8P55286 799 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms