RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.62■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.62■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.62■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 IGLV3-19P01714 112 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 SERPINA4P29622 427 aa22.6■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF185O15231 689 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.59■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 SNX1Q13596 522 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 PID1Q7Z2X4 250 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF567Q8N184 647 aa22.58■■□□□ 1.2
HOXD4-201ENST00000306324 TEKT5Q96M29 485 aa22.58■■□□□ 1.2
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