RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MC1RQ01726 317 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CCINQ13939 588 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MEGF6O75095 1541 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 C9IYK1 514 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GNRH1P01148 92 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GJA1P17302 382 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 ST13P50502 369 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GJA9P57773 515 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 TNS4Q8IZW8 715 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 LENG9Q96B70 501 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 C5orf34Q96MH7 638 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX10Q9Y5X0 201 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MC4RP32245 332 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GLUD2P49448 558 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 ITGADQ13349 1161 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 EID3Q8N140 333 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CPS1P31327 1500 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 RPTORQ8N122 1335 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 IRS2Q9Y4H2 1338 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MYL12BO14950 172 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PGAM1P18669 254 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP2C18P33260 490 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 TMPRSS11BQ86T26 416 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 IL31RAQ8NI17 732 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 HERVK_113Q902F9 699 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.97□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 EPHB6O15197 1021 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKCGP05129 697 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SP2Q02086 613 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 TBC1D25Q3MII6 688 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR141Q7Z602 305 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 DAW1Q8N136 415 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PQJ5 194 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MMP3P08254 477 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 NRLP54845 237 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 DSG1Q02413 1049 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC20A2Q08357 652 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 UGCGQ16739 394 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 STK32CQ86UX6 486 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 DEC1Q9P2X7 70 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 ITSN1Q15811 1721 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CATP04040 527 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CREMQ03060 361 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 TAF10Q12962 218 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CTBP1Q13363 440 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 VITQ6UXI7 678 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 AHI1Q8N157 1196 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 CADM2Q8N3J6 435 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP3K14Q99558 947 aa11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBASH3B-201ENST00000284273 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DGCR6Q14129 220 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM220AQ7Z4H9 259 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 CDYL2Q8N8U2 506 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 MARCH7Q9H992 704 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF521Q96K83 1311 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 PDHA2P29803 388 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NFATC2Q13469 925 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.96□□□□□ -0.5
UBASH3B-201ENST00000284273 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81 ms