RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 CDH17Q12864 832 aa22.96■■□□□ 1.27
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UFD1-201ENST00000263202 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 DEC1Q9P2X7 70 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 GJA4P35212 333 aa22.96■■□□□ 1.27
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UFD1-201ENST00000263202 DEFB123Q8N688 67 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NFS1Q9Y697 457 aa22.96■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 AP3B1O00203 1094 aa22.95■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.95■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa22.94■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.94■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.94■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 SYBUQ9NX95 663 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 BFARQ9NZS9 450 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.94■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.94■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SRLQ86TD4 932 aa22.94■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.93■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.93■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 TRIB3Q96RU7 358 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 IL22Q9GZX6 179 aa22.92■■□□□ 1.26
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UFD1-201ENST00000263202 IGSF6O95976 241 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 DLG2Q15700 870 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 PTPRNQ16849 979 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 ACCSLQ4AC99 568 aa22.92■■□□□ 1.26
UFD1-201ENST00000263202 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.92■■□□□ 1.26
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