RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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