RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR107Q5VW38 600 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNERQ8NFT8 737 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ISL2Q96A47 359 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM167AQ96KS9 214 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAT9Q9BTE0 207 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMOXQ9NWM0 555 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.45■■□□□ 1.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 J3QRK9 145 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDHD2O94830 711 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSPA13P48723 471 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANO4Q32M45 955 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXL8Q96CD0 374 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 AKAP5P24588 427 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAB1Q13506 487 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BORAQ6PGQ7 559 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 LBX2Q6XYB7 198 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 NAT16Q8N8M0 369 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 STYXQ8WUJ0 223 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF286BP0CG31 522 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 COL6A2P12110 1019 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 RHDQ02161 417 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SULT2A1Q06520 285 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSHL1Q14406 222 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRPSAP1Q14558 356 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 FGD3Q5JSP0 725 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIGZQ86VD9 579 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYGBQ8WWM9 190 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ASB7Q9H672 318 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS28Q9UK41 221 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CITO14578 2027 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEATR9A2RTY3 570 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 HACD1B0YJ81 288 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPTLC1O15269 473 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 MCF2P10911 925 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLUD2P49448 558 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM26Q6ZUK4 368 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR141Q7Z602 305 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SETD4Q9NVD3 440 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCAP29Q9UHQ4 241 aa21.44■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TIMM44O43615 452 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TADA2AO75478 443 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 C22orf31O95567 290 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRM5P41594 1212 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP1A4Q13733 1029 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM35AQ86V20 835 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPPL2CQ8IUH8 684 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SMYD1Q8NB12 490 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PNPLA3Q9NST1 481 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 THEGQ9P2T0 379 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 MRASO14807 208 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CABYRO75952 493 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP2C8P10632 490 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BNIP3Q12983 259 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRP8Q14114 963 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BBS5Q8N3I7 341 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 LZTR1Q8N653 840 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.43■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 MATKP42679 507 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAS2R39P59534 338 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 NEDD8Q15843 81 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 NHSL2Q5HYW2 709 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CNTD1Q8N815 330 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 EXT2Q93063 718 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 GPR22Q99680 433 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 IL22Q9GZX6 179 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CASS4Q9NQ75 786 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PFDN4Q9NQP4 134 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD300CQ08708 224 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PMS2P3Q13401 168 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 EPHX4Q8IUS5 362 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 INIPQ9NRY2 104 aa21.42■■□□□ 1.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACOT9Q9Y305 439 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms