RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 EXD1Q8NHP7 514 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MAML1Q92585 1016 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FATE1Q969F0 183 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SEPT3Q9UH03 358 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MEI4A8MW99 385 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3LB9A6J9 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 APOL1O14791 398 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SPINT1O43278 529 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 LATO43561 262 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 GDF9O60383 454 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PIGNO95427 931 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3HP0C7X1 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ADRB3P13945 408 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCNCP24863 283 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCR5P51681 352 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ALG3Q92685 438 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 OLFM3Q96PB7 478 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CAPN10Q9HC96 672 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CEP250Q9BV73 2442 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD36A6QL64 1941 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MATN3O15232 486 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TIMP2P16035 220 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CD27P26842 260 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DPP6P42658 865 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ABL2P42684 1182 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NEK3P51956 506 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RFX6Q8HWS3 928 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HDAC11Q96DB2 347 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 LGMNQ99538 433 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MGME1Q9BQP7 344 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SUV39H2Q9H5I1 410 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DYRK4Q9NR20 520 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DKK3Q9UBP4 350 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PLXNA2O75051 1894 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 KNL1Q8NG31 2342 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPC4 97 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN11A1L157 253 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MX2P20592 715 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RENBPP51606 427 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RAD51Q06609 339 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 IHHQ14623 411 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MARC1Q5VT66 337 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TRIM69Q86WT6 500 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM9Q86XI8 627 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PREBQ9HCU5 417 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 LNP1A1A4G5 178 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCDC66A2RUB6 948 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 WNT9AO14904 365 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 AREL1O15033 823 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 AP1G1O43747 822 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CST8O60676 142 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SERPINF2P08697 491 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ITIH2P19823 946 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MMP13P45452 471 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SCNN1BP51168 640 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MAXP61244 160 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 DYNLT1P63172 113 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms