RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233084.7

DDX1-201, Transcript of DEAD-box helicase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX1, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1-201ENST00000233084 TADA2AO75478 443 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TTKP33981 857 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ZNF132P52740 706 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 KRT76Q01546 638 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SELENBP1Q13228 472 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TFDP2Q14188 446 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 DCLK2Q8N568 766 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TCF12Q99081 682 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ARPC5LQ9BPX5 153 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MROQ9BYG7 248 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 KLHL3Q9UH77 587 aa15.95■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TMEM114B3SHH9 223 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 GRID2O43424 1007 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CA12O43570 354 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SAT1P21673 171 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 PTPN9P43378 593 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NIPAL4Q0D2K0 466 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MAPK11Q15759 364 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ARMCX2Q7L311 632 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 DPH6Q7L8W6 267 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SEPT3Q9UH03 358 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ANKRD34BA5PLL1 514 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ARIH2O95376 493 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NCAM1P13591 858 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MGAT1P26572 445 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MAGEA3P43357 314 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 RNF157Q96PX1 679 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 KLQ9UEF7 1012 aa15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ARID2Q68CP9 1835 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ASB14A6NK59 587 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 KPNA7A9QM74 516 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TK2O00142 265 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NR4A2P43354 598 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 GRIA4P48058 902 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 GLRBP48167 497 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NAGLUP54802 743 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MYL6P60660 151 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SP4Q02446 784 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MORN1Q5T089 497 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CAMK1DQ8IU85 385 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TERB1Q8NA31 727 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CSF3RQ99062 836 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 HTTP42858 3142 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 JRKO75564 520 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 IL18RAPO95256 599 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 JAK3P52333 1124 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CLDN10P78369 228 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 IFITM3Q01628 133 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 DGKDQ16760 1214 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 INSCQ1MX18 579 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 INAVAQ3KP66 663 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TBCELQ5QJ74 424 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 MCUQ8NE86 351 aa15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 A0A096LPK6 155 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 APOL1O14791 398 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 KRT75O95678 551 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CHEK2O96017 543 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CTGFP29279 349 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SFNP31947 248 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 DPP9Q86TI2 863 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 ANKFN1Q8N957 763 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NETO2Q8NC67 525 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CEP41Q9BYV8 373 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 RAP2CQ9Y3L5 183 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TCAF1Q9Y4C2 921 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.92■□□□□ 0.14
DDX1-201ENST00000233084 CLDN25C9JDP6 229 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms