RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ITM2BQ9Y287 266 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.01■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CAPN8A6NHC0 703 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 FAM72CH0Y354 149 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 POP4O95707 220 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ETFBP38117 255 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 NOMO3P69849 1222 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ATP11AP98196 1134 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RAPGEF1Q13905 1077 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MYLK3Q32MK0 819 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 C3orf38Q5JPI3 329 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PERM1Q5SV97 790 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 FAM72AQ5TYM5 149 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 FAM72DQ6L9T8 149 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 FAM72BQ86X60 149 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RBFAQ8N0V3 343 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 EMC1Q8N766 993 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 BTN2A2Q8WVV5 523 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CPA5Q8WXQ8 436 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TBATAQ96M53 351 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 IL12RB2Q99665 862 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 SEMA4CQ9C0C4 833 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 SPASTQ9UBP0 616 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 NEU3Q9UQ49 428 aa16■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CDRT15L2A8MXV6 281 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TCEA3O75764 348 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 GSRP00390 522 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MMEP08473 750 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RHOQP17081 205 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 IGFALSP35858 605 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MAPKAPK2P49137 400 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 VAC14Q08AM6 782 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 C1orf61Q13536 156 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 NR0B2Q15466 257 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CCDC14Q49A88 953 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 NAA35Q5VZE5 725 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CLPBQ9H078 707 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MAGEH1Q9H213 219 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 DNAI1Q9UI46 699 aa15.99■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 LMO7DNF2Z398 122 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 KRIT1O00522 736 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 NEMP1O14524 444 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 YY2O15391 372 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 UGT2B4P06133 528 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 UCHL3P15374 230 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 YPEL5P62699 121 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PTK2BQ14289 1009 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PRRT3Q5FWE3 981 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PHACTR4Q8IZ21 702 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 EPS8L1Q8TE68 723 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RXFP2Q8WXD0 754 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 LRRC61Q9BV99 259 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 STK33Q9BYT3 514 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TENM4Q6N022 2769 aa15.98■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 J3QKU1 62 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 K7ENP7 123 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TOR1BO14657 336 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MUSKO15146 869 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 KDELR3O43731 214 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MMP20O60882 483 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 LRIG2O94898 1065 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TIMP2P16035 220 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ITIH2P19823 946 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 MMP8P22894 467 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 RPIAP49247 311 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 THOP1P52888 689 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 PDX1P52945 283 aa15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NME3-201ENST00000219302 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms