RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 GEN1Q17RS7 908 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EMC10Q5UCC4 262 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CES4AQ5XG92 561 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf40Q86WS4 652 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GPATCH11Q8N954 259 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IL12RB2Q99665 862 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PATJQ8NI35 1801 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 KRT87PA6NCN2 255 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NEMP2A6NFY4 417 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TMCC1O94876 653 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HAUS5O94927 633 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARSAP15289 507 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCNCP24863 283 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PSEN1P49768 467 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CNSTQ6PJW8 725 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZVU0 165 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PIM3Q86V86 326 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RASSF3Q86WH2 238 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 HERVK_113Q902F9 699 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RUBCNQ92622 972 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EXT2Q93063 718 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PGM2Q96G03 612 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CERS2Q96G23 380 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MYRFLQ96LU7 910 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TDP1Q9NUW8 608 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EURLQ9NYK6 297 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MYLKQ15746 1914 aa6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TPP1O14773 563 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ARNTP27540 789 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RENBPP51606 427 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM215Q68D42 235 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SMC6Q96SB8 1091 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HACD1B0YJ81 288 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 AHSGP02765 367 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CD72P21854 359 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC6A11P48066 632 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HCAR3P49019 387 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 KCNMB4Q86W47 210 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CHST14Q8NCH0 376 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ESAMQ96AP7 390 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf74Q96LT6 269 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CD84Q9UIB8 345 aa6.65□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CACNA1EQ15878 2313 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GVM2 712 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 MTX2O75431 263 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 POLBP06746 335 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 BGNP21810 368 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 PHBP35232 272 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TRAF2Q12933 501 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IFT88Q13099 833 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 GRM3Q14832 879 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 CYTH1Q15438 398 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 IER5LQ5T953 404 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RANBP10Q6VN20 620 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 RAPH1Q70E73 1250 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 TSPAN33Q86UF1 283 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 DCLK2Q8N568 766 aa6.64□□□□□ -1.35
CNIH1-201ENST00000216416 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms