RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigaQ64323 485 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q80Y73 168 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb17Q91VD8 799 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cwh43Q91YL7 699 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ak5Q920P5 562 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cog2Q921L5 731 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KlbQ99N32 1043 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 StambpQ9CQ26 424 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PgcQ9D7R7 392 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Coro1cQ9WUM4 474 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GghQ9Z0L8 317 aa12.81□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fibcd1A2AV25 459 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm15155B1B034 138 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf518bB2RRE4 1077 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FaahO08914 579 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oas1aP11928 367 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd11b2P51661 386 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ikzf1Q03267 517 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KrtdapQ3V2T4 102 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prss36Q5K2P8 849 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a4Q60857 630 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crtc1Q68ED7 630 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gramd1bQ80TI0 738 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd10Q8BKG4 582 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oas1gQ8K469 367 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr345Q8VGK4 311 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnh1Q91VI7 456 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb18Q91Y02 792 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pbx4Q99NE9 378 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oaz3Q9R109 243 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Malrd1A2AJX4 2123 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pramef17A2ASJ1 475 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox3cA2AWM0 215 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Osbpl8B9EJ86 889 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9330159F19RikD3Z623 648 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnt2D3Z649 1135 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28043E0CXC2 719 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11239E9Q5Z9 360 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11237F2Z3W5 360 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11238F2Z478 360 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox3hL7MU37 215 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Man2b1O09159 1013 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcn4O70507 1186 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr2cP34968 459 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptpn1P35821 432 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc26a1P58735 704 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TceancQ3US16 359 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm428Q3UTE2 360 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox3aQ4TU90 215 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr20Q7TRX9 314 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sema3dQ8BH34 777 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ca12Q8CI85 354 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pacs1Q8K212 961 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eva1bQ8K2Y3 164 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox18Q8VC74 331 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Barhl2Q8VIB5 384 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt5Q922U2 580 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arpc2Q9CVB6 300 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufa13Q9ERS2 144 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stap1Q9JM90 297 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp11cQ9QZW0 1129 aa12.8□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kat6aQ8BZ21 2003 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif6E9PX57 802 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EsrraO08580 422 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kifc3O35231 824 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnmt3cP0DOY1 709 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 UmpsP13439 481 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lsp1P19973 330 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CblP22682 913 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6dP35459 127 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TubP50586 505 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RnaselQ05921 735 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam109bQ14B98 259 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb48Q1H9T6 681 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Heatr9Q5QNV8 569 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TCAIMQ66JZ4 499 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyorgQ69ZQ1 716 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vtcn1Q7TSP5 283 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp8Q80U87 1080 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xylt1Q811B1 953 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plin5Q8BVZ1 463 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CopaQ8CIE6 1224 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpdlQ8K248 371 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw7Q8VBV4 629 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam192aQ91WE2 254 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp617Q91WM0 559 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atpaf2Q91YY4 289 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dok4Q99KE3 325 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim42Q9D2H5 723 aa12.79□□□□□ -0.36
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cldn22Q9D7U6 220 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms