RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	COPS8	Q99627	209 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FAS	P25445	335 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GMIP	Q9P107	970 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NFAT5	O94916	1531 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	INHA	P05111	366 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LBP	P18428	481 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CXCR2	P25025	360 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	HDAC10	Q969S8	669 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NDN	Q99608	321 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FTH1	P02794	183 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CYP3A5	P20815	502 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	HPCAL1	P37235	193 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SLC5A3	P53794	718 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TCEA2	Q15560	299 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LILRA4	P59901	499 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DHFR2	Q86XF0	187 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FGF19	O95750	216 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GALNT3	Q14435	633 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SERPINI2	O75830	405 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	C1R	P00736	705 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ABHD2	P08910	425 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CTBP1	Q13363	440 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FZD9	O00144	591 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MDM4	O15151	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ARHGEF9	O43307	516 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GNRH1	P01148	92 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CLTB	P09497	229 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ME2	P23368	584 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	UBXN8	O00124	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RAB10	P61026	200 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ART4	Q93070	314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MYOM1	P52179	1685 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18

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