RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		22.3	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	KRT12	Q99456	494 aa		22.3	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		22.3	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		22.3	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		22.3	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ALDH1A2	O94788	518 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	GABRG2	P18507	467 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	RENBP	P51606	427 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TTC27	Q6P3X3	843 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	RASSF3	Q86WH2	238 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	HMGB4	Q8WW32	186 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	VAT1	Q99536	393 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	FBRS	Q9HAH7	460 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		22.29	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	BNIP3L	O60238	219 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ECEL1	O95672	775 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	GAS8	O95995	478 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	CCNB1	P14635	433 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	NDUFV2	P19404	249 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	HOXA6	P31267	233 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ACTN2	P35609	894 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	CYTH1	Q15438	398 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MARC1	Q5VT66	337 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	STK40	Q8N2I9	435 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	CCDC89	Q8N998	374 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PRSS33	Q8NF86	280 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MAML1	Q92585	1016 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	USP29	Q9HBJ7	922 aa		22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	22.28	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	KCNK1	O00180	336 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PEX11B	O96011	259 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF235	Q14590	738 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	CACUL1	Q86Y37	369 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PGBD3	Q8N328	593 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	PRRX2	Q99811	253 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	LHX3	Q9UBR4	397 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	EBF1	Q9UH73	591 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		22.27	■■□□□ 1.16
LTBP4-227	ENST00000600026	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF103	O00237	685 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	GSR	P00390	522 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	IFNB1	P01574	187 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	JCHAIN	P01591	159 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SP9	P0CG40	484 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PTPN3	P26045	913 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	MMP13	P45452	471 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	FNTB	P49356	437 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RHOA	P61586	193 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	DR1	Q01658	176 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PPP1R7	Q15435	360 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TEX44	Q53QW1	395 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	CARD16	Q5EG05	197 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SLCO2A1	Q92959	643 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RTP4	Q96DX8	246 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM129B	Q96TA1	746 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	IL12RB2	Q99665	862 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SEPT3	Q9UH03	358 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	AMACR	Q9UHK6	382 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		22.26	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	C5orf60	A6NFR6	353 aa		22.25	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	AXIN1	O15169	862 aa		22.25	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	22.25	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	22.25	■■□□□ 1.15
LTBP4-227	ENST00000600026	P3H1	Q32P28	736 aa		22.25	■■□□□ 1.15

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