RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596016.5

STRN4-213, Transcript of striatin 4, human

TSL 4

Gene STRN4, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRN4-213	ENST00000596016	ARF5	P84085	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	SNX19	Q92543	992 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	BIRC7	Q96CA5	298 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	SARDH	Q9UL12	918 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		13.74	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	SLC7A4	O43246	635 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KDELR3	O43731	214 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CD27	P26842	260 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CHRNA3	P32297	505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KAZN	Q674X7	775 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	EXD1	Q8NHP7	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KRT35	Q92764	455 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.73	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CEP104	O60308	925 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CD160	O95971	181 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PRNP	P04156	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KDELR1	P24390	212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	DRD3	P35462	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	MARCKSL1	P49006	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	METAP1	P53582	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ADPRH	P54922	357 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TFDP2	Q14188	446 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	DPYSL2	Q16555	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CA9	Q16790	459 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	HES6	Q96HZ4	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	WDR24	Q96S15	920 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZNF670	Q9BS34	389 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.72	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016		A0A1W2PPC4	97 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PLK4	O00444	970 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CTSL	P07711	333 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	SERPINB6	P35237	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CCR5	P51681	352 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	COPS2	P61201	443 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	DYNLT1	P63172	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	CNTN1	Q12860	1018 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
STRN4-213	ENST00000596016	PARP15	Q460N3	678 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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