RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 MED7O43513 233 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PAGE1O75459 146 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 GRAP2O75791 330 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CNTN5O94779 1100 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TSHRP16473 764 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 NDUFA8P51970 172 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ARL10Q8N8L6 244 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 STK32AQ8WU08 396 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 HPSEQ9Y251 543 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 FLNCQ14315 2725 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRK2Q5S007 2527 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPAN6O43657 245 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEF10O60809 474 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CTSEP14091 401 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ITIH1P19827 911 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPK10P53779 464 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PFN3P60673 137 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PPARDQ03181 441 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS36Q86VN1 386 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 KYQ8NBH2 561 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0D9SEW6 157 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 THAP12O43422 761 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 AP1G1O43747 822 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CLCA4Q14CN2 919 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 C4orf17Q53FE4 359 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ALFQ53S48 1182 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM110Q86TL2 294 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CLPBQ9H078 707 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 PRCPP42785 496 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ELOCQ15369 112 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 CARD16Q5EG05 197 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 RETSATQ6NUM9 610 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC31Q6UY01 552 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF19Q8IW93 802 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 USP7Q93009 1102 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA32Q96LK8 384 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRN3Q9H3W5 708 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR34Q9UPC5 381 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 ITM2BQ9Y287 266 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 TEX15Q9BXT5 2789 aa22.14■■□□□ 1.14
CAPNS1-205ENST00000588780 HSF2BPO75031 334 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ALPIP09923 528 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CR2P20023 1033 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 OR1E1P30953 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CCKBRP32239 447 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 BLKP51451 505 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PDCLQ13371 301 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 IGFBP7Q16270 282 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 RD3Q7Z3Z2 195 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 HID1Q8IV36 788 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 OR7D4Q8NG98 312 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 TBATAQ96M53 351 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 EPN3Q9H201 632 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 GGT7Q9UJ14 662 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQM1 296 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 GLI1P08151 1106 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 WT1P19544 449 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 MORC3Q14149 939 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms