RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 NETO2Q8NC67 525 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 SP110Q9HB58 689 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 RAB21Q9UL25 225 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 J3KR12 359 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 MCF2LO15068 1137 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 RAD51CO43502 376 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 MFSD11O43934 449 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TMCC1O94876 653 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 DNTTP04053 509 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 KRT10P13645 584 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 FNTAP49354 379 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 IL10RBQ08334 325 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CST6Q15828 149 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 RLN3Q8WXF3 142 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 AMACRQ9UHK6 382 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 SCML1Q9UN30 329 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 PROB1E7EW31 1015 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 BNIP3LO60238 219 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 IGLV3-19P01714 112 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 DR1Q01658 176 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CEP68Q76N32 757 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 PLPP6Q8IY26 295 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 ADH1BP00325 375 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TPMTP51580 245 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 SLC7A5Q01650 507 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CCNG2Q16589 344 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 CD93Q9NPY3 652 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 INVSQ9Y283 1065 aa20.45■□□□□ 0.87
ATG4D-208ENST00000588667 APOL1O14791 398 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 GSRP00390 522 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 IL1BP01584 269 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PSMD8P48556 350 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 GALNT2Q10471 571 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 TFDP2Q14188 446 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BRD3Q15059 726 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 CARD16Q5EG05 197 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BBS12Q6ZW61 710 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RFX6Q8HWS3 928 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PLD5Q8N7P1 536 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 TTC13Q8NBP0 860 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF599Q96NL3 588 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 CCDC151A5D8V7 595 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 FAM187AA6NFU0 413 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 MID1O15344 667 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 MAFKO60675 156 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 C5AR1P21730 350 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 BCKDHBP21953 392 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 RHOAP61586 193 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 VSNL1P62760 191 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 GBE1Q04446 702 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4D-208ENST00000588667 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms