RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588618.5

ACTN4-210, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN4, Length 1,729 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-210ENST00000588618 SEMA3CQ99985 751 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 CA14Q9ULX7 337 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MUC3AQ02505 3323 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ANXA9O76027 345 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 CES1P23141 567 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PTPRNQ16849 979 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FCRL5Q96RD9 977 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 LHX3Q9UBR4 397 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ATP9BO43861 1147 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 KDM1BQ8NB78 822 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 WNT16Q9UBV4 365 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 HCN2Q9UL51 889 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 NPC1O15118 1278 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TMEM63AO94886 807 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 APRTP07741 180 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MMP2P08253 660 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ITIH2P19823 946 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MAPK8P45983 427 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ITGA8P53708 1063 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SEC13P55735 322 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 DSC2Q02487 901 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PRKCQQ04759 706 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SEMA5AQ13591 1074 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ZNF234Q14588 700 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 KCNJ11Q14654 390 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 CHPFQ8IZ52 775 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 IFT81Q8WYA0 676 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SHDQ96IW2 340 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 WHRNQ9P202 907 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SHISA7A6NL88 538 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 EGFP01133 1207 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 SERPINF2P08697 491 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 CR2P20023 1033 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 CD86P42081 329 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 GEMP55040 296 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 RAD51Q06609 339 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 RUBCNQ92622 972 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.268e-7■□□□□ 10.9
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ACTN4-210ENST00000588618 UBP1Q9NZI7 540 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 TTC34A8MYJ7 566 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 K7EQS6 105 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 INSIG1O15503 277 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 UQCRHP07919 91 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 MCM3P25205 808 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PLTPP55058 493 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 OLIG2Q13516 323 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FBXO43Q4G163 708 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 WDR93Q6P2C0 686 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 Q6ZVU0 165 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTN4-210ENST00000588618 VPS45Q9NRW7 570 aa22.91■■□□□ 1.26
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