RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587775.1

TMUB2-208, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3

Gene TMUB2, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-208	ENST00000587775		K7ESF4	209 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ALOX15B	O15296	676 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	INSIG1	O15503	277 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	OPHN1	O60890	802 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SIN3B	O75182	1162 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ALAD	P13716	330 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	HLA-E	P13747	358 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ETS1	P14921	441 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CES1	P23141	567 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MMP13	P45452	471 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CRY1	Q16526	586 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MYLK3	Q32MK0	819 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ODF2	Q5BJF6	829 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	RANBP10	Q6VN20	620 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775		Q6ZVU0	165 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	RASSF3	Q86WH2	238 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CHST14	Q8NCH0	376 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CCNY	Q8ND76	341 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	TMIE	Q8NEW7	156 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	EXOC4	Q96A65	974 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	IER2	Q9BTL4	223 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CIPC	Q9C0C6	399 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	NOD2	Q9HC29	1040 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	9.27	□□□□□ -0.93	2e-7	■■■□□ 15.8
TMUB2-208	ENST00000587775	SUN2	Q9UH99	717 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	TMEM221	A6NGB7	291 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775		H7C0C1	242 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775		M0R296	226 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	KCNN4	O15554	427 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SPINT1	O43278	529 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SUN1	O94901	812 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	EPO	P01588	193 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	IGLV3-19	P01714	112 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PSMA3	P25788	255 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	DRD3	P35462	400 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	TIE1	P35590	1138 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PAFAH1B1	P43034	410 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MAGEA9	P43362	315 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ATP5O	P48047	213 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MAX	P61244	160 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	AP1B1	Q10567	949 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SEMA5A	Q13591	1074 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SNX1	Q13596	522 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PTK6	Q13882	451 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	E2F5	Q15329	346 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CDKN3	Q16667	212 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PARP6	Q2NL67	630 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	DUPD1	Q68J44	220 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SRL	Q86TD4	932 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ZNF366	Q8N895	744 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	UCMA	Q8WVF2	138 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	CEP41	Q9BYV8	373 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	GBA3	Q9H227	469 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SP110	Q9HB58	689 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	DKK3	Q9UBP4	350 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	EBF1	Q9UH73	591 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	RAD51C	O43502	376 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	GPR37L1	O60883	481 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
TMUB2-208	ENST00000587775	GABRG2	P18507	467 aa		9.25	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms