RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578446.1

USP22-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 3

Gene USP22, Length 605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-208	ENST00000578446	SEMA3C	Q99985	751 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	IER2	Q9BTL4	223 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GBA3	Q9H227	469 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GCAT	O75600	419 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GJB3	O75712	270 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	AOC1	P19801	751 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	NFKB1	P19838	968 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	RGR	P47804	291 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SCNN1B	P51168	640 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	RAD51	Q06609	339 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	FZD5	Q13467	585 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	MYLK3	Q32MK0	819 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SYT13	Q7L8C5	426 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PLPP6	Q8IY26	295 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	STK40	Q8N2I9	435 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CHST14	Q8NCH0	376 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PTPRN2	Q92932	1015 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CARD6	Q9BX69	1037 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	FBRS	Q9HAH7	460 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GLOD4	Q9HC38	313 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PAK5	Q9P286	719 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	IL36A	Q9UHA7	158 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.81	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446		A0A1W2PQF6	199 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ALOX15B	O15296	676 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	INSIG1	O15503	277 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SLC34A2	O95436	690 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	KRT14	P02533	472 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PRNP	P04156	253 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SERPINF2	P08697	491 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CR2	P20023	1033 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CA4	P22748	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CES1	P23141	567 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PSMB4	P28070	264 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SERPINA4	P29622	427 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CD86	P42081	329 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PSMD8	P48556	350 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CSNK1D	P48730	415 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	VPS41	P49754	854 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CLCN5	P51795	746 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	DGKE	P52429	567 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	MTAP	Q13126	283 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GAS6	Q14393	721 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	GRM3	Q14832	879 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CRY1	Q16526	586 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CFAP58	Q5T655	872 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	C4orf22	Q6V702	233 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SRL	Q86TD4	932 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CACUL1	Q86Y37	369 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	OR2T3	Q8NH03	318 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	SLCO2A1	Q92959	643 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		10.8	□□□□□ -0.68
USP22-208	ENST00000578446	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.8	□□□□□ -0.68

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