RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 EOGTQ5NDL2 527 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 CENPPQ6IPU0 288 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 HACE1Q8IYU2 909 aa4.05□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 CPA6Q8N4T0 437 aa4.05□□□□□ -1.76
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HERC1-211ENST00000560983 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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HERC1-211ENST00000560983 KRT23Q9C075 422 aa4.05□□□□□ -1.76
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HERC1-211ENST00000560983 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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HERC1-211ENST00000560983 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.04□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 TSC2P49815 1807 aa4.04□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 PDZD2O15018 2839 aa4.03□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.03□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 SMCO2A6NFE2 343 aa4.03□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
HERC1-211ENST00000560983 CHMP2AO43633 222 aa4.03□□□□□ -1.76
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