RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TNK2Q07912 1038 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 HASPINQ8TF76 798 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B2P37059 387 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CERS5Q8N5B7 392 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 MYL12AP19105 171 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CCNA2P20248 432 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 C21orf59P57076 290 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SLC34A1Q06495 639 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ITGA7Q13683 1181 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.58□□□□□ -1.04
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