RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 NUMA1Q14980 2115 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MUSKO15146 869 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PYGMP11217 842 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MX2P20592 715 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CCNCP24863 283 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PTGER3P43115 390 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 AADACL2Q6P093 401 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SGK2Q9HBY8 427 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SEPT3Q9UH03 358 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 COPS2P61201 443 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 RAD51Q06609 339 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PPP2R5EQ16537 467 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SRLQ86TD4 932 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PGBD5Q8N414 524 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 DCLK2Q8N568 766 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CCNYQ8ND76 341 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HES6Q96HZ4 224 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 LOXL4Q96JB6 756 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 LGMNQ99538 433 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 FZD4Q9ULV1 537 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SHROOM3Q8TF72 1996 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MATN3O15232 486 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 GJB3O75712 270 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SEMA4FO95754 770 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CSNK1DP48730 415 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ZNF33AQ06730 810 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MARC1Q5VT66 337 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 TEX26Q8N6G2 289 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 KLHL32Q96NJ5 620 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PSKH2Q96QS6 385 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 GPR179Q6PRD1 2367 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 METTL12A8MUP2 240 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 GFRA3O60609 400 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 EPN2O95208 641 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 UGT2B4P06133 528 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 RETP07949 1114 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 SCNN1BP51168 640 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 RENBPP51606 427 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ZNF235Q14590 738 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 GDPD4Q6W3E5 623 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 MAML1Q92585 1016 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HDAC11Q96DB2 347 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 HSPA12BQ96MM6 686 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 OLFM3Q96PB7 478 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 DYRK4Q9NR20 520 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 NCDNQ9UBB6 729 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.83■■□□□ 1.25
BRF1-216ENST00000550208 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 TGM2P21980 687 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 MMP13P45452 471 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 NR2C2P49116 596 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 CREB5Q02930 508 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 PDK1Q15118 436 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 ZNF805Q5CZA5 627 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 AGBL4Q5VU57 503 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 BBS12Q6ZW61 710 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 RUBCNQ92622 972 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 HAUS1Q96CS2 278 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-216ENST00000550208 HDAC8Q9BY41 377 aa22.82■■□□□ 1.24
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